Bệnh viện hoạt động theo mô hình bệnh viện trong ngày với 4 khoa chức năng, bao gồm khoa khám bệnh trong ngày, khoa phẫu thuật Phaco điều trị đục thủy tinh thể, Laser Excimer điều trị tật khúc xạ (cận, viễn và loạn thị) trong ngày, khoa cận lâm sàng và khoa dược.
Điểm đặc biệt là bệnh viện có tổ chức các dịch vụ như: khám cho bệnh nhân VIP, chọn Bác sĩ khám và phẫu thuật theo yêu cầu. Các dịch vụ khám và điều trị về mắt được thực hiện trong ngày, giảm thời gian chờ đợi và tạo sự thoải mái cao nhất cho bệnh nhân.
Các dịch vụ tại Bệnh viện Mắt Kỹ thuật cao Phương Nam:
1. Khám mắt – Đo khúc xạ
2. Chẩn đoán hình ảnh
3. Phẫu thuật Phaco điều trị đục thủy tinh thể
4. Phẫu thuật Lasik điều trị cận, viễn, loạn thị
5. Phẫu thuật thẩm mỹ
6. Ngoại trú lé, Glaucoma, Võng mạc tiểu đường
7. Phòng khám khô mắt
8. Phòng khám AMD